卓越学院是杭州电子科技大学为实施优秀创新型人才培养计划而建的荣誉学院，是杭电优秀学子荣誉的象征，是未来杰出校友的摇篮。学院前身是创办于2005年的杭电理科实验班和文科实验班。从2012年开始，学校从录取的新生中选拔约100名成绩优异的学生进入卓越学院学习，现设理工类实验班、经管类实验班和特招班三个大类。学院依托全校优质资源，拥有一支以中青年专家教授、博士等教师为骨干的导师团队，导师团队现有专业导师87人、思政导师2人、学业导师8人，其中正高职称40人，88%以上教师具有副高以上职称，70%以上教师具有博士学位，学科领域涉及工、理、经、管、法、艺、文等。学院坚持“以生为本、引导为先；转变观念、追求卓越”的办学理念，积极创立多学科专业复合交叉的特色人才培养模式，努力培养基础宽厚，知识、能力、素质、体格俱佳，具有国际视野和持久竞争力的高素质优秀人才和杰出工程领导者。
学院实行四年一贯制、学分制、导师制和滚动制，采用“1.5+2.5”两段制培养模式。第一阶段集中学习通识教育课程和学科大类基础课程，注重基础知识和工程素质培养，强化数理、外语、人文、哲学和工程创意训练，执行独立的培养计划，选派优秀教师担任课程教学，广泛采用研讨性等小班化教学模式改革，同时配备班主任、思政导师和学业导师；第二阶段重点开展个性化专业培养，强化学科大类核心课程、综合实践能力和个性化课程培养，在专业导师（组）指导下按要求单独制定个性化专业培养方案和科研训练计划，在专业学院共同监管下完成个性化专业培养过程，其学籍管理在卓越学院。在提前修满本科学分条件下，鼓励学生提前毕业或继续深造。学生按规定享受专业选择自主权和优质资源使用权。第一学期末和第二学期末，可参与学校组织的“转专业”及学院组织的动态选拔。第二学期末，学生根据专业兴趣与特长选择专业趣向，第三学期确定各自的专业，按“双向选择”的方式确定专业导师。卓越学院学生在使用计算机、优质课程资源、图书资料和实验室等方面享受本校研究生待遇；优秀奖学金的评定比例比普通班级高出45％；优先参加学科性竞赛和相关培训；优先享受国际交流机会；优先推荐报考本校研究生；在卓越学院完成学业毕业的学生，学校同时发给杭州电子科技大学荣誉学院证书。
经管类实验班（含会计学、财务管理、审计学、金融学、信息管理与信息系统）
1、 采用准研究生培养模式
2、可在全校范围内自主选择专业
3、 奖学金比例达75%
专业背景&就业前景：培养具备信息技术背景、卓越创新精神、宽广国际视野的经管类拔尖人才。具备特殊培养政策，为每位学生配备专业导师，学生可在导师指导下个性化选择专业课程并参加科研实训；注重创新能力培养，资助学生开展科研活动，高端学者和企业家每月开设卓越讲座；所在学院考研上线率50%、出国访学率20%，就业学生普遍能进入名企、政府机关、事业单位工作。
理工类实验班（含电子信息工程、计算机科学与技术、软件工程、通信工程、电气工程及其自动化、机械设计制造及其自动化）
1、 采用准研究生培养模式
2、可在全校范围内自主选择专业
3、 奖学金比例达75%
专业背景&就业前景：培养信息技术领域具备卓越创新精神、宽广国际视野、较高人文素养的理工类拔尖人才。具备特殊培养政策，为每位学生配备专业导师，学生可在导师指导下个性化选择专业课程并参加科研实训；注重创新能力培养，资助学生开展科研活动，高端学者和企业家每月开设卓越讲座；所在学院考研上线率50%、出国访学率20%，就业学生普遍能进入名企工作。